末日孤舰第四季由数万人参与游玩的死亡网络游戏“THE NEW GATE”，在主人公桐谷进也的不懈努力下通关获得解放。然而，正当他认为已经打败最终头目，并且可以离开时，却突然被传送至500年后的游戏世界……